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教你使用半经验方法研究正丁烷稳定性

发布时间:2016-06-14 14:20:32

在分子动力学的研究过程中有多种计算方法,比较常见的是从头算方法和半经验方法,如果绘制者对这些基础知识不了解不能完全掌握Chem 3D软件的使用方法,本节ChemDraw使用技巧将结合Chem3D软件讲解如何使用AM1半经验方法研究正丁烷结构的稳定性。

1、半经验方法基础知识

分子动力学是一门结合物理,数学和化学的综合技术,主要用于分子模拟,工作原理是牛顿力学来模拟分子体系的运动。分子动力学的第一原理是基于分子轨道理论的从头算法和密度泛函理论,利用薛定谔方程对体系所有电子进行计算,得到体系的总能量,从而可以分析各个性能。从头算方法包括HF、MP2、DFT、GVB、MCSCF、CI以及CC等,半经验方法包括MNDO、AM1、PM3。因为半经验法由于只计算部分的波函数积分,同时对电子间和电子与原子核的相互作用进行了简化,所以可以大大缩减计算时间,在合理的近似下可以得到满意的结果。这里需要注意一下,半经验方法的应用具有很大的局限性,使用前一定要了解各种半经验算法的适用范围。

2、半经验研究正丁烷稳定性方法

1、首先在Chem 3D的ChemDraw绘制区域画出想要的正丁烷结构,在Chem 3D窗口会弹出对应的立体模型,如下图所示。

半经验研究正丁烷稳定性
半经验研究正丁烷稳定性

2、按住Shift键单击选中需要计算的键和原子,依次选择Calculations菜单下GAMESS Interface命令的Predict IR/Raman Spectrum子命令,在弹出对话框的Method区域选择AM1半经验方法,然后单击Run开始运行计算。

以上就是使用AM1半经验方法计算正丁烷结构稳定性的教程,不同的计算方法应用不同的范围,主要根据研究体系来选择,学习更多Chem 3D软件的使用技巧请点击怎么在Chem 3D软件中改变背景?

标签:半经验方法正丁烷Chem3D软件

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