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ChemDraw中文官网 > 知识储备 > 实例讲解ChemDraw支持的SMD File格式文件

实例讲解ChemDraw支持的SMD File格式文件

发布时间:2015/07/23

SMD File(Standard Molecular Data File)格式文件是ChemDraw支持的众多化学格式文件之一,ChemDraw可以利用自身的文件解释程序来支持多种格式的ChemDraw文档解释。本次内容将以Cyclohexanol结构为实例为您条分缕析ChemDraw支持的MD File格式文件的内容。

Cyclohexanol结构即为环己醇,是无色透明油状液体或白色针状结晶,有似樟脑丸气味。并且可微溶于水,混溶于乙醇、乙酸、乙酯、乙醚、二硫化碳和油类。ChemDraw解释Cyclohexanol(环己醇)的数标如下所示:

解释Cyclohexanol(环己醇)的数标
解释Cyclohexanol(环己醇)的数标

一、SMD File格式文件下的Cyclohexanol结构

line 1            >  STRT cyclohexan

line 2            > DTCR ChemDraw

line 3            > CT        0 03-MAR-92 12:23:58

line 4            15

line 5            7  7(A2,5I2)(2I4,4I2)

line 6            C

line 7            C

line 8            C

line 9            C

line 10          C

line 11          C

line 12          O

line 13                 1   2   1

line 14                 2   3   1

line 15                 3   4   1

line 16                 4   5   1

line 17                 5   6   1

line 18                 1   6   1

line 19                 6   7   1

line 20          > CO Points 8

line 21          2(2I8)

line 22                 24040     2700

line 23                 24040     900

line 24                 25600     0

line 25                 27160     900

line 26                 27160     2700

line 27                 25600     3600

line 28                 28715     3600

line 29         > LB 2

line 30                 1(I3,X,A)

line 31                 7: OH

【注意】行数只是为了方便说明而添加的。

二、ChemDraw解释SMD File格式文件下的Cyclohexanol结构

每一行既表示间隔行、模块标头行又表示一个含有多个关于结构信息符号组的数据记录。SMD File格式文件被分为几个信息模块,每个模块的标头前用“>”标记开始。独立的各符号组是由空格来限制的。解释ChemDraw 支持的SMD File格式文件中符号组信息如下:

1、line 1 名为STRT模块。此模块含有分子名称,当文件用ChemDraw建立时,分子名称也是文件名称。

2、line 2 名为DTCR模块。此行含有的信息包括应用软件的名称——ChemDraw,以及ChemDraw建立的文件、日期和时间。

3、line 3 名为CT模块。同时指示含在模块中记录的数(体现在line 4 中的15),此模块中的信息包括Connection Table 格式的化学结构。

4、line 5 包含4个符号组:含2个符号组。第一组是从Cartesian直角坐标转换到实际直角坐标系的比例系数,第二组是FORTRAN格式的原子坐标。

5、line 6~12 每行含一个描述原子类型的符号。原子类型可由一个元素组成,整个的原子标记在这里并不表示出来,只给出原子标记中的第一个原子。

6、line 13~19 属于CT模块,每行含3个描述连接原子的键的符号组。第一组是键开始端的原子的系列数(1),第二组是键端的系列数(6),第三组是键的级数(1)。

7、line 20 名为CO模块。指示了用在图形中的单位(此实例中是点)和在此模块中的行数(此实例中是8)。在此模块中的信息包括Cartesian直角坐标,该坐标为右手Cartesian坐标系统。

8、line21 含两个符号组。第一组是从Cartesian直角坐标转换到实际坐标系的比例系数,第二组是FORTRAN格式的原子坐标。

9、line22~28 每行含在CT模块中的每个原子的Cartesian直角坐标。

10、line 29 名为LB模块。同时指示含在模块中记录的数(此实例中是2)。

11、line 30 含有两个符号组,第一组是有完全原子标记的原子的数目,第二组是FORTRAN格式的有完全原子标记的原子的数目。

12、line 31 含有两个符号组,描述了在结构中任何未分析的完整的原子标记。第一组是未分析的原子标记的系列数目(7),第二组是完全的原子标记(OH)。

以上就是有关SMD File格式的ChemDraw文档的内容,希望能有助于您理解ChemDraw是如何解释SMD File格式文件。若想了解更多ChemDraw支持的化学格式文件的学习内容请点击实例讲解ChemDraw支持的Connection Table 文件

标签:ChemDraw支持SMD File格式文件ChemDraw文档

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