ChemDraw怎么显示原子编号 ChemDraw原子编号顺序怎么调整

ChemDraw怎么显示原子编号 ChemDraw原子编号顺序怎么调整

在论文配图、反应机理说明、核磁归属、结构比对和实验记录整理当中，经常会遇到ChemDraw如何显示原子编号以及怎样调整编号顺序的问题，ChemDraw里的原子编号大致可以分成两类，一类是文档绘图设置中显示的普通原子编号，另一类是和结构命名相关的IUPAC编号；前者更多用在绘图和检查结构上，后者更偏向命名规则与结构解释，所以操作前先要把用途分清，根据Revvity官方支持说明，ChemDraw默认情况下自动编号是关闭的，用户可在【Document Settings】的【Drawing】设置中查看【Show Atom Numbers】选项，较新版本还涉及【Preferences】里【Building/Display】下的IUPAC原子编号显示选项。

一、ChemDraw怎么显示原子编号

在显示原子编号前，先要确认是给整张图的结构显示编号，还是只在某一个分子上做论文标注；如果只是临时核对结构，用户直接打开自动编号就行，若要放进论文图里，后面还需检查编号的位置、字号和导出效果。

1、打开文档绘图设置

打开ChemDraw文件之后，通过点击顶部菜单【File】→【Document Settings】，可以进入当前文档的设置窗口；这里控制的是当前文档的绘图显示效果，不一定会对软件里所有新文件起作用，官方说明也提到，Document Settings主要作用于当前文档，而Object Settings才是针对选中对象的局部设置。

2、进入Drawing设置

在左侧设置列表里选择【Drawing】，找到和原子编号有关的【Show Atom Numbers】，如果该选项没有被勾选，就把它勾上，再点击【OK】；回到画布后，结构中原子旁边就会显示出编号，这通常被用来检查结构内部原子的顺序。

3、只让需要的结构显示编号

如果画布里存在多个结构，一开始不必把所有结构的编号都打开；可以先选中目标结构，再检查它的对象设置或局部显示效果，因为多结构图里编号太多，容易遮挡化学键线条、连接的基团和反应箭头，后期导出到Word或图片时也会显得很杂乱。

4、对编号外观进行调整

编号显示以后，如果编号太贴近键线，可以适当移动结构、拉开一些局部空间，或者调整文档字体和对象比例；需要注意，不要把原子符号、键线和编号挤在一起，尤其是杂环、稠环、糖环和多取代苯环，编号位置不清楚就会影响读图。

5、保存样式前先做测试

如果希望以后新建文件也能保持相似的显示方式，可在样式文件里保存这些设置；不过，建议先用一份测试文件确认效果，免得所有新结构都自动带上编号，后面复制到报告或PPT里还要一个一个关掉。

二、ChemDraw原子编号顺序怎么调整

ChemDraw里的原子编号顺序并不是普通的文本序号，不能简单地认为选中数字就能直接改成想要的顺序；自动原子编号通常和结构内部的原子顺序、画图过程以及命名规则有关，不同显示方式背后的逻辑也不一样。

1、先判断编号的来源

如果编号来自【Show Atom Numbers】，它更接近ChemDraw对当前结构对象的内部原子顺序显示；如果编号来自结构命名或IUPAC相关功能，它就会受到命名规则的影响，ChemDraw用户指南中提到，使用结构转名称功能时，可以把IUPAC原子编号显示出来，并且相关显示可在【Preferences】→【Building/Display】中进行设置。

2、普通编号不满意就重新绘制

如果只是普通的显示编号，一种常用的处理方式是，用户从希望作为起点的那个原子开始，重新把结构画出来；比如想让环上的某个原子成为1号，就可以从该位置出发画键，再按照期望的方向继续画出完整结构，画完之后再打开编号检查，很多时候这比在旧结构上反复修改要省事一些。

3、不要把Clean Up当成重新编号的工具

【Clean Up Structure】主要被用来整理结构的布局，使键长、角度和整体排版更规整，它能改善图形的外观，但不一定会按照论文所希望的阅读顺序去重新安排编号；如果编号顺序和预期不一样，单靠清理结构通常不能解决根本问题。

4、论文标注可以采用手动编号

如果编号是给论文说明、实验归属或图注引用用的，并不要求参与化学文件内部数据，那么用户可以用【Text】工具手动输入1、2、3这样的编号，再把这些数字放到对应原子的旁边；这样排版自由度更高，也不容易受软件自动规则的干扰，需要注意，这种数字只是图面上的标注，并不等于化学结构文件里真实的原子编号。

5、命名编号不要强行改动

如果需要的是IUPAC编号，其顺序应当服从命名规则，不建议为了图面的习惯而强行改成另一套编号；这时更合适的做法是检查结构的画法、官能团、母体结构和取代基是否正确，再用结构转名称功能重新生成结果。

三、ChemDraw原子编号显示不对怎么办

当ChemDraw原子编号显示不对时，使用者先不要急着去改动数字本身；很多问题是由于显示类型选错了、结构没有被ChemDraw识别为完整结构、手动标注和自动编号混在了一起，或者复制粘贴后对象属性发生了变化。

1、检查结构是否完整连接

用户可以用选择工具框选整个分子，确认它是一个完整的结构对象；如果结构是从图片、PDF或其他文档里复制过来的，ChemDraw可能只把它当成图形对象，编号功能就不能正常按原子来识别，遇到这种情况，建议重新绘制，或者用结构识别功能处理之后再检查。

2、检查是否混用了两套编号

有些文件里既打开了【Show Atom Numbers】，又用【Text】工具手动添加了编号，看起来就好像编号重复了或者顺序乱了；此时可以先关闭【Show Atom Numbers】，只留下手动标注，也可以把手动文字删掉，只观察自动编号的结果。

3、检查偏好设置

如果正在使用结构转名称功能，可进入【File】→【Preferences】→【Building/Display】，查看与IUPAC原子编号相关的选项是否开启；在较新版本中，这个选项会影响结构转名称或名称转结构过程中的IUPAC编号显示，它和普通文档编号不是同一回事。

4、导出前检查显示效果

编号显示正常之后，再导出图片、复制到Word或放进PPT里检查一次；有时候在ChemDraw画布里看起来正好，导出后编号却显得太小或太靠近键线，正式使用前建议导出一张图片放大检查，确认编号没有挡住原子标签、正负电荷以及立体化学符号。

总结

ChemDraw怎么显示原子编号，ChemDraw原子编号顺序怎么调整，关键在于使用者先区分普通原子编号、IUPAC编号和人工标注编号；临时检查结构时，可通过【File】→【Document Settings】→【Drawing】把【Show Atom Numbers】打开，涉及结构命名时，要关注【Preferences】→【Building/Display】里的IUPAC编号显示，论文配图只需要固定编号位置时，手动文本标注往往更容易控制；编号顺序不合适时，不要只盯着数字去改，而应先把结构对象、绘制起点、命名规则和显示设置检查清楚，这样排查起来会更稳妥。