发布时间:2026-06-02 13: 40: 00
在 ChemDraw 里面怎么设置键角大小,以及键角改完之后结构又该怎么去校正,这两个问题是需要连着一起处理的;很多人在画结构式的时候,发现键角不顺、环状结构歪歪扭扭,或者链状结构被拉得太开,于是就直接去拖动单个原子来调整,结果反而越改越乱,实际上,ChemDraw 中的键角主要是由固定角度、链角和文档设置这几项来决定的,我们把结构修改完以后,还要用清理结构和检查结构的功能,对外观做一次校正,再对化学内容做一次检查;软件的官方说明也提到过,在绘制结构的时候,它会使用固定的键长和键角,而这些数值是由文档的类型和文档设置来决定的。
一、ChemDraw 怎么设置键角大小
我们在 ChemDraw 里设置键角的时候,不能只盯着画布上的某一根键去拖拽,比较正常的做法是,先去看一下固定角度这个选项有没有被打开,接着再进到文档的绘图设置里去调整链角,这样一来,后面我们继续画结构的时候,角度才能照着同一套规则来。
1、打开固定角度的选项
我们先在 ChemDraw 里把结构文件打开,然后从【Object】菜单里找到【Fixed Angles】,看看它前面是不是已经打上了勾,勾选好之后,当我们再用单键、双键这些工具继续画结构的时候,软件就会按照固定的角度去限制新画出来的化学键;根据官方的用户指南,这个固定角度一般用的是 120 度的链角,或者按照 15 度一档的方式来限制绘制的方向。
2、进入文档的绘图设置
需要去调整键角的数值时,我们就进入【File】菜单下的【Document Settings】,再点开【Drawing】,在这个页面里面找到【Chains Angle】这一栏,然后把数值改成自己需要的角度,比如普通的链状结构可以继续保留 120 度,而某些图例场景需要排得更紧凑一点,就可以按照排版的要求把数值改小或者改大,设置好之后点击【OK】,当前这个文档就会按照新的绘图参数继续工作了。
3、把固定角度和自由拖动画区分开
要是我们只是想临时画一根不受固定角度限制的键,可以先按住【Alt】键,然后再去拖动画键,用这个方法来处理局部的说明图、过渡态的草图或者特殊的空间示意是比较合适的,但是不太建议在整篇的反应式里大量地去用,不然同一页上面结构的键角就会显得很零散,不够统一;官方的支持说明里也写着,按住 Alt 去拖的时候,能够暂时取消对固定键长和固定角度的限制。
4、不要把缩放操作当成是在设置键角
有些结构看上去角度不太对劲,这其实是因为键长、字体和缩放比例之间不协调造成的,而不是键角本身的问题;碰到这种情况,我们不要急着去改链角的数值,可以先选中这个结构,然后看一看键长、字号和页面比例是不是跟当前的图稿保持一致,因为论文里的图、课件里的图和专利里的图,对结构排版的要求都不一样,键角的设置需要去配合整个版面,而不是单单去追求某一个角度数字。
二、ChemDraw 键角改完后结构怎么校正
键角的数值改完以后,结构并不一定立刻就会变得规整起来,那些已经画好的结构,很可能还保留着原来的键长、键角和原子的位置,因此我们得先把它选中,然后去执行清理的命令,让软件重新把外观整理一遍。
1、选中需要校正的结构
我们可以用【选取框】这个选择工具,去把整个分子结构都框选起来;如果只选中了一部分,ChemDraw 就只会处理被选中的那一块,像环状结构、桥环结构或者带有立体键的结构,就容易出现局部被拉动,但是整体没有跟着一起变的情况,所以对于环状结构,建议大家把整个环全部选中以后再去清理,不要只选其中的一两根键。
2、执行结构清理的命令
把结构选中之后,我们就可以进入【Structure】菜单,找到【Clean Up Structure】,也可以直接用快捷键【Shift】+【Ctrl】+【K】;这个命令的作用是整理分子的外观,让它的键长和键角变得更加统一,根据用户指南的说明,Clean Up Structure 是用来把键长和键角给标准化的,而箭头、芳香环上面的圆圈这些图形对象,是不会被这个命令处理的。
3、必要的时候再重复清理一次
对于那些复杂分子、被手工拖拽过很多次的结构,还有从别的软件里复制过来的结构,只执行一次清理结构,有时候结果不一定就完全合适;我们可以观察一下结构是不是在局部还有扭曲的地方,如果看着还是明显不够顺,就再一次把同一个结构选中,再执行一回【Clean Up Structure】,官方的用户指南里面也提醒过,这个命令是按照反复计算的方式去重绘结构的,有的时候执行一次确实不够。
4、检查立体化学的信息有没有被影响到
结构被清理之后,我们还得重点去查看一下楔形键、虚线键、手性中心还有双键的构型,虽然 Clean Up Structure 会尽量把立体化学的含义保留下来,但是图形的位置还是有可能发生改变,特别是当有好几个手性中心相邻的时候,肉眼看上去可能会跟原来的图不完全一样;我们在做论文的配图或者反应机理图的时候,清理完成之后一定要一个一个地去确认那些关键的立体信息。
三、ChemDraw 键角调整后还要检查什么
当我们把 ChemDraw 里的键角都调整好以后,这并不说明化学结构本身就已经完全没有问题了,画面变得规整,只不过是第一层的检查,接下来我们还要去留意一下价态、连接关系、文本标签以及复制和导出之后的效果。
1、检查价态和连接关系
我们可以先把结构选中,然后进入【Structure】菜单里的【Check Structure】,要是结构里面有不正常的价态、孤零零的化学键、原子离得很近却没有真正连在一起这类问题,软件就会给出提示;根据用户指南的说法,Check Structure 能够检查选中结构里面的价态、元素和已经定义好的昵称,一旦碰到不正确的结构,就会弹出一个提示的窗口。
2、查看红色波浪形的提示
要是画布上面出现了红色的波浪框,我们不要只把它当成一种显示的干扰,可以把鼠标挪到提示的位置上,或者点一下右键来查看说明,通常就能看到 ChemDraw 认为什么地方存在着化学语法上的问题;常见的情形有:键没有真正接到原子上、原子的价态不太合理、手性中心缺少了必要的表达等等。
3、核对模板和文档的设置
如果我们把同一个结构复制到另外一个 ChemDraw 文件里,它的外观就有可能会发生变化,因为那个被复制进去的文件有自己的文档设置;当我们需要统一版式的时候,可以尽量在同一个文件里面把结构都画好,或者通过【File】菜单里的【Apply Document Settings】去统一文档的参数,这样操作下来,不同结构之间的键长、键角、字号还有线宽,就会更加协调一些。
4、导出之前做一次整体排版的检查
结构校正都做完以后,我们还要再去看一看反应箭头、条件文字、编号、注释这些东西和结构之间的距离,因为 Clean Up Structure 主要是去处理分子结构它本身,并不会自动帮我们把整页的反应式都排好;要是这些图要用在论文、报告或者专利里面,比较建议的做法是,在导出之前先放大检查一遍,然后再复制到 Word、PPT 或者排版软件里面,看看有没有发生变形。
总结
总的来说,关于 ChemDraw 怎么设置键角大小和键角改完之后怎么校正结构,实际动手的时候,我们可以按照一个比较清楚的顺序来:先用【Object】→【Fixed Angles】确认固定角度已经打开,接着到【File】→【Document Settings】→【Drawing】里面对【Chains Angle】进行修改,等画完以后,把结构选中,去执行【Structure】→【Clean Up Structure】,然后再用【Check Structure】检查一下价态和连接关系;这样一套处理下来,结构图就不容易歪歪扭扭的,也能减少在后期复制、排版和投稿的时候出现的那些结构上的错误。
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