ChemDraw分子量怎么计算 ChemDraw分子量结果和手算不一致怎么办

ChemDraw分子量的计算，和软件给出的结果跟手算对不上时的处理，多数情况下并不是软件本身算错，而是结构、氢原子数目、盐的形式、同位素、平均分子量和精确质量这几样没有统一起来。ChemDraw可以显示分子式、Exact Mass、Molecular Weight、m/e和元素分析这些信息；其中Molecular Weight与Exact Mass所用的计算口径本来就不一样，前者更接近平均原子量的算法，后者则按照常见同位素的质量来计算。

一、ChemDraw分子量怎么计算

计算分子量之前，需要先确认所画的结构是完整的，不少差异并不是出在按下计算按钮这一步，而是因为结构里面漏掉了电荷、盐、结晶水，或者某种键型导致ChemDraw自动识别的氢原子个数和手算结果不一致。

1、先检查分子结构

分子量的计算要从结构的完整性开始查看，像芳香环、杂原子的价态、电荷、离子对、盐酸盐、钠盐、溶剂化物，这些都应该画清楚。要是只画了一个游离碱，手算却按照盐酸盐去算，那结果肯定对不上。

2、打开分析窗口

通过【View】菜单里的分析窗口，可以查看分子式、分子量、精确质量和元素组成，这里不能只盯着一个数字看。

分子式可以先帮忙判断原子个数是不是正确，分子量通常用来作为常规摩尔质量的参考，精确质量则更多地用在质谱相关的计算里。如果分子式已经和预期的不一样，后面的所有质量结果就不需要再往下比了，应该先回头把结构改好。

3、确认选择的范围

在ChemDraw里面，要是只选中了某一部分结构，分析窗口可能就只显示被选中对象的结果；要是没有选中任何对象，一般会显示整页或者当前结构的结果。复杂的反应式里面含有好几个分子的时候，要分清楚自己计算的到底是一个化合物，还是把反应物、试剂和产物全都算进去了。

二、ChemDraw分子量结果和手算不一致怎么办

当结果不一致的时候，不要马上就去怀疑软件，也不要直接去改数字，比较稳当的做法，是先去核对分子式，然后再去核对质量的计算口径，最后再去看同位素和特殊的结构。

1、先比分子式

先把ChemDraw显示的分子式和手算的分子式，一项一项地对照着看，C、H、N、O、卤素、金属离子、水合物，都要分开比较。最容易出现的问题，就是氢原子的数目不一样，例如季铵盐、羧酸盐、酚盐、质子化胺、互变异构结构，这些都可能让手算的结果和软件识别的结果出现差异。

2、区分分子量和精确质量

Molecular Weight和Exact Mass不能混在一起来比，分子量一般使用标准的原子量，所以同位素的丰度会影响到平均值；精确质量则是按特定的同位素质量来计算的。不同的版本，或者不同的原子量表，也可能让最后几位小数出现一点差别，ChemDraw计算分子量的时候，用的是IUPAC的标准原子量，不同的数据库或者旧版软件，可能会有细微的出入。

3、检查盐和溶剂

论文、试剂瓶上的标签，还有实验记录里面，经常写的是盐型或者水合物，比如hydrochloride、sodium salt、monohydrate这些。要是ChemDraw里面只画了母体分子，手算的时候却把HCl、Na或者H₂O也加进去了，那结果就会差一截。碰到这种情况，要先把计算的对象统一起来，再去做比较。

三、ChemDraw分子量结果怎么避免反复出错

分子量的计算，看起来好像很简单，但在论文、投料、质谱、元素分析里面，用途是不一样的。前期把计算的口径交代清楚了，后面就不容易反反复复地改动。

1、固定计算的对象

同一个化合物，要说明它是游离形式、盐型、水合物，还是反应混合物里面的某一个组分。实验投料一般要按照实际称量的形式去计算，质谱解释则常常要看离子形式和精确质量，不能只靠一个数字去应对所有的场景。

2、保留分子式的记录

在【Analysis Window】里面，同时核对分子式和质量的结果，有必要的时候，就把分子式写进实验记录里面。

分子式比一个单独的分子量数字，更容易进行复查。以后别人发现质量不一样，也可以先看看是不是分子式不同，而不是直接去争论小数点后面的位数。

3、留意质谱的计算口径

m/e、Exact Mass和实际检测到的离子峰，并不能简单地画等号，质谱里面还可能涉及到加氢、脱氢、钠加合、铵加合、同位素峰和多电荷离子。拿ChemDraw的结果去辅助判断的时候，要先明确自己比较的到底是中性分子，还是某一种离子的形式。

总结

ChemDraw分子量怎么计算，ChemDraw分子量结果和手算不一致怎么办，可以按照“先检查结构，再核对分子式，再区分Molecular Weight和Exact Mass，最后检查盐型、溶剂和离子形式”这样的顺序来处理。大多数的差异，并不是计算本身出了问题，而是计算的对象和口径没有被统一起来。只要把结构画完整、把质量的类型选对、先把分子式核准好，ChemDraw的分子量结果就更容易和手算的结果对应上。