ChemDraw立体化学标记怎么设置 ChemDraw立体化学楔形键显示异常怎么办

ChemDraw立体化学标记的设置方法，还有显示楔形键时碰到不正常的情况该怎么处理，是在绘制手性化合物、反应路线和论文结构式的时候，很容易遇到的一类问题。立体化学标记并不是仅仅把键画成粗的三角或者虚线就完成了，它需要与手性中心、取代基的朝向，以及结构清理以后得到的结果，相互协调起来。楔形键的方向一旦出了错，轻则整张图看起来比较别扭，重则可能让读者把构型给理解错了，尤其是在涉及R/S构型、异构体之间的对比，还有合成路线的时候，更要小心地去处理。

一、ChemDraw立体化学标记怎么设置

在ChemDraw里面，常用的立体化学表达，主要依靠实楔形键、虚楔形键、波浪键和普通的单键来共同完成。在开始设置之前，需要先判断所要表达的是一个已经确定的构型，还是一个未知的构型，又或者是混合物，或者是没有被指定下来的构型。这些不同的情况，是不能混在一起使用的。

1、先把手性中心的位置确定下来

手性中心一般会出现在连着四个不同取代基的碳原子上面，在画图的时候，要先看清楚是哪一个原子需要把空间方向表达出来，而不是随手就把某一条键改成楔形键。要是手性中心被选错了，那么后面就算图形画得很规范，它所代表的化学含义也仍然是错误的。

2、通过楔形键工具，把方向设定好

在【Bond工具】当中，先挑中实楔形键或者虚楔形键，再去连接手性中心和它对应的那个取代基。

实楔形键通常是用来表达这根键从纸面往外的方向，虚楔形键则是表达键向着纸面内侧的方向。在绘制的过程中，需要留意楔形键较宽的那一端和较窄的那一端，因为方向不一样，所表达的空间关系也会不同。不能只是去看它“是不是像个楔形”，还要看它到底是从哪一个原子出发，指向哪一个取代基。

3、利用结构检查的功能，去辅助判断

画完以后，可以通过结构检查，或者名称与结构互相转换的功能，去辅助分析这个构型是否合理。如果结构里面没有包含明确的立体信息，软件就有可能会识别不出R/S构型；要是楔形键彼此发生了冲突，由软件生成的名称，或者检查出来的结果，也有可能会出现异常。到了这一步，不能完全去依赖自动的判断，人工的核对依然是很有必要的。

二、ChemDraw立体化学楔形键显示异常怎么办

楔形键显示不正常的时候，比较常见的一些表现，是楔形键的方向反了、粗细不对头、虚线不够清晰、键重叠在一起，或者是在复制到Word、PPT以后发生了变形。碰到这类问题，不要只是来回地去拖动键线，而是应该先去看一看结构本身，以及显示的样式，是不是存在什么毛病。

1、去检查键所连接的那个对象

假如楔形键并没有真正地连到手性中心上面，而只是端点的位置稍微偏了一点，那么显示出来的样子，可能看着还过得去，但结构识别这一块，就会出错了。这种情况，在复制粘贴、导入结构，或者用手工画图的时候，是比较容易出现的。可以把结构放大一些，去检查键的端点，是不是准确地吸附在了原子的上面。

2、把结构的布局重新清理一遍

选中结构以后，去使用【Clean Up Structure】这个功能，让ChemDraw把键角、键长和局部的排版，再重新整理一次。

要是原来的结构是从PDF、网页，或者其他软件里面复制过来的，这里面就有可能会藏着一些看不到的对象、相互重叠的键，或者是坐标不太规则。把结构清理过以后，很多楔形键粗细不对劲、角度不自然，以及取代基挤在一起的这些状况，就会得到一些缓解。

3、检查文档的样式设定

如果在ChemDraw里面一切正常，可复制到Word或者PPT以后，就不对劲了，那问题有可能是出在粘贴的格式，或者显示的缩放上面。可以试着去用图片的格式、对象的格式，或者是高分辨率的导出方式，再重新把它插入进去。在论文和报告里面，最好是能把模板的样式统一起来，避免在同一篇文档里面，有的楔形键显得很粗，有的又显得很细。

三、ChemDraw立体化学标记怎么减少错误

在立体化学上面，出现错误的原因，往往并不是软件本身不会画，而是在前一个阶段，没有把构型给确认清楚，到了后一个阶段，又只是去关注排版好不好看。特别是那些带了好几个手性中心的化合物，更是需要按照顺序，一个一个地去检查。

1、不要随意地拿楔形键去美化结构

楔形键它并不是一个装饰用的符号。在构型还没有明确的时候，不能为了让结构看起来“更立体一些”，就随意地给它加上楔形键。如果仅仅是想表达未知的构型，或者是还没有被指定下来的构型，那就应当去使用一种更加合适的表达方式，从而避免让读者误以为，这个构型已经是确定好了的。

2、对于有好几个手性中心的分子，要逐个去核对

当一个分子里面，存在好多个手性中心的时候，就不能只是去看总体的结构是不是好看。每一个手性中心所连着的实楔形键、虚楔形键，还有普通的键，都是需要单独去核对的。当改动过一个取代基的位置以后，它周围的那一套立体关系，很有可能也需要重新再去检查一遍。

3、在导出以前，做一次最终的检查

在提交论文、专利或者报告以前，最好是去检查一下结构式、构型的标注、编号，以及反应物和产物，看它们是不是都能够对得上。特别是同一种化合物，在正文、路线图和实验部分，反复出现的时候，要避免前后的楔形键方向出现不一致的情况。

总结

ChemDraw立体化学标记应该怎样去设置，以及立体化学里面楔形键显示不正常的时候又该怎么去处理，这里面的关键，是先要把手性中心和构型的含义给确认下来，然后再使用实楔形键、虚楔形键，或者是其他的标记，去准确地把它们表达出来。当楔形键出现异常的时候，应当去检查键的端点、结构的布局、文档的样式，还有导出的方式，而不是仅仅靠眼睛的观察，去拖动和调整。立体化学图并不只是一个单纯的排版问题，把它画得规范了，后面的论文、报告和反应路线，才不容易让人产生误解。