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为你解密ChemBio3D有哪些功能

发布时间:2016-09-20 10: 43: 39

ChemBio3D是为化学家及生物学家设计的一款出色的桌面版分子模拟软件,它是ChemOffice软件包的核心插件之一,功能帮助用户模拟分子模型和分子运动,下文将详细列举ChemBio3D有哪些功能,快来发掘还有哪些你都没用过的功能!

ChemBio3D功能列表:

1、能量最小计算:能量最小化计算考察分子的稳定结构,或通过软件提供的MOPAC、Jaguar, GANESS及Gaussian的接口,进行从头计算或半经验计算,甚至NMR,IR或Raman光谱的预测,其中MM2-对分子进行初步的能量最小化计算,MOPAC-半经验算法, MMFF94-12.0版本新增加力场,而GAMESS、 Jaguar好Gaussian-从头计算。

2、ChemBio3D能够计算分子更多的物化性质,以平面进行旋转,计算能量最小构造,以下图为例,图A是最低能量构造侧视图,图B是最低能量构造俯视图,图C是分子所在两个平面的夹角对能量的影响。

三种能量最小构造
三种能量最小构造

3、物化性质计算:ChemBio3D可计算分子更多的物化性质。ChemProp Pro包括固有变量计算,如沸点、临界压力、温度和体积、亨利定律常数、熔点、蒸汽压和水溶性等。ChemPro Std包括形式电荷、几个Connolly变量、准确质量、椭圆度等。CLogP Driver能够计算提供摩尔折射率和分配系数,支持GAMESS程序接口、Jaguar程序接口、MOPAC程序接口。另外,Molecular Topology可用于测量分子拓扑学的诸多方面,包括Balaban指数、Cluster Count、一些旋转键、形状系数、拓扑直径和其它参数等。

物化性质计算
物化性质计算

4、分子表面:ChemBio3D可以快速,准确的计算出化合物的分子表面并提供多种方式显示分子表面。不用五分钟,用户就可以使用ChemBio3D绘制出1,3-二丁烯及其最高占用分子轨道,以及乙醇和它的最低空轨道。在新版本中,还可进行更多的参数设定,如:探针半径、掩藏或显示溶剂分子、反射率半分比、表面透明性、分子上被选择部分的分子表面在特定的距离间是否被限制等。

这项创新功能令人震惊,从长远来看它必将成为ChemOffice、ChemBio3D分子模拟软件对医药化学和物理化学的贡献,学习更多绘制技巧请点击为你详细介绍ChemBioOffice整合的桌面组件

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标签:ChemBio3D分子模拟分子模拟软件

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