教你计算三种分子性质的方法

分子和化学反应拥有许多性质，比如分子的能量和结构、振动频率、红外和拉曼光谱、分子轨道、NMR 屏蔽和磁化系数以及静电势和电子密度等，计算分子性质是化学研究的重点，但是完成分子计算并不是一件容易事情。Chem 3D软件作为世界一流的化学工具，功能提供简单易行的计算分子构型的方法，本节ChemDraw使用技巧将介绍使用Chem 3D软件计算分子性质的三种方法。

方法1：MM2分子动力学

这一计算分子性质的原理是采用MM2分子动力学方法研究构型在一定温度下构型的转变，操作方法是在Chem 3D绘制窗口画好分子构型之后，单击Calculations菜单或Calculations工具条的MM2命令，即可快速计算该分子构型在不同情况下的数值。

方法2：GAMESS软件包

使用Chem 3D软件的GAMESS软件包可以进行IR、Raman以及NMR光谱的理论模拟和预测。操作方法是单击Calculations菜单并选择GAMESS Interface命令，然后从其子命令中分别选择Predict IR/Paman Spectrum、Predict UV/Vis Spectrum或者Predict NMR Spectrum。正丁烷IR/Raman谱图的AM1计算结果如下图所示：

正丁烷IR/Raman谱图

温馨提示：使用Chem 3D软件计算分子构性性质之前，需要先进行构型优化。

方法3：分子轨道拓扑图像

绘制分子轨道的拓扑图像也是计算分子性质的方法之一，具体操作方法是在构型优化后，在Chem 3D软件中选择Surfaces菜单下的Choose Surface选项，默认情况下，绘制的是最高占据轨道(HOMO)，最低未占据轨道是LUMO，所以需要继续选择Choose Surface的子选项Select Molecular Orbital来选择所要绘制的分子轨道，效果图如下。

Chem 3D软件绘制分子轨道

以上就是使用Chem 3D软件计算三个不同分子构性的方法，熟练掌握后有助于分析分子性质，更多精彩教程请点击 教你用ChemOffice快速画苯甲酸结构。